Ο Καποδίστριας από την πρώτη στιγμή που έμαθε ότι θα είναι ο Κυβερνήτης της Ελλάδος αποφάσισε την καθιέρωση του Φοίνικα και αυτό είχε και συμβολική και ουσιαστική σημασία. Μάλιστα στο πρώτο νόμισμα του νέου Ελληνικού κράτους δεν ήταν η δραχμή, αλλά ο Φοίνικας. Μετά την δολοφονία του Καποδίστρια ο Φοίνικας εξαφανίστηκε πάλι και εμφανίστηκε 136 χρόνια μετά, την 21η Απριλίου του 1967!
Ποιοι ήταν οι εχθροί του Καποδίστρια; Όχι πάντως οι Μανιάτες, παραδοσιακά Ρωσόφιλοι, ούτε καν οι Μαυρομιχαλαίοι, οι οποίοι ευρέθησαν ενάντιοί του από μία σύγκρουση σχεδόν προσωπική και όχι μάλιστα του Πετρόμπεη. Ποιοι ήταν οι εχθροί του Κυβερνήτη; Τους προσδιορίζει ο ίδιος, μιλώντας για τους Άγγλους και τους Γάλλους, που ήθελαν μία Ελλάδα υποτελή στα συμφέροντά τους ΠΕΡΙΟΡΙΣΜΈΝΗ στην Πελοπόννησο! Προσθέτει σε αυτούς τα μέλη «μυστικών εταιρειών» της Αγγλίας και της Γαλλίας.
Ο πόλεμος κατά του Καποδίστρια ήταν ανελέητος και δημιούργησε το κλίμα, που οδήγησε στην δολοφονία του. Ο Πετρόμπεης δεν ήταν άνθρωπος ούτε των Άγγλων, ούτε των Γάλλων. Μάλιστα είχε πρωτοστατήσει στην εκλογή του Καποδίστρια ως κυβερνήτη και ήταν διορισμένος από τον Καποδίστρια Γερουσιαστής. Πως φτάσαμε στην δολοφονία; Στην Μεσσηνία Νότια προς την Μάνη αμέσως μετά την αποχώρηση του Ιμπραήμ υπήρχε καθεστώς αναρχίας, το οποίο θέλησαν να εκμεταλλευτούν συγγενείς του Πετρόμπεη, Μαυρομιχαλαίοι, για το προσωπικό τους συμφέρον, διατηρώντας… τελωνείο στο Λιμένι (!) της Μάνης. Ο Πετρόμπεης ζήτησε την άδεια από τον Καποδίστρια για να πάει στην Μάνη και να επιβάλει την τάξη. Δεν του δόθηκε. Έφυγε χωρίς άδεια, συνελήφθη, φυλακίστηκε.
Ο Ρώσος Ναύαρχος Ρίκορντ μεσολάβησε για την απελευθέρωσή του. Αυτή τελικά δεν έγινε και έτσι φτάσαμε στην δολοφονία του Καποδίστρια σύμφωνα με την καθιερωμένη άποψη από τους Μαυρομιχαλαίους, τον Κωνσταντίνο και τον γιο του Πετρόμπεη Γιώργη. Υπάρχει τα τελευταία χρόνια μία άποψη ότι δεν ήταν οι Μαυρομιχαλαίοι οι δολοφόνοι, αλλά ότι ήταν στο σημείο της δολοφονίας και αυτό ήταν πολύ βολικό γι’ αυτούς που ήθελαν να κρύψουν τους αληθινούς δολοφόνους. Ήταν πολλοί αυτοί που έγραψαν πάντως ότι πίσω από την δολοφονία του Καποδίστρια ήταν οι Άγγλοι, που ήταν «Τούρκοι με κόκκινες λιβρέες» σύμφωνα με τον Κυβερνήτη. Πάντως χρόνια μετά την δολοφονία στην Αθήνα ο Πετρόμπεης Μαυρομιχάλης, σύμφωνα με ένα βιβλίο του 1903 (ΟΙ ΜΑΥΡΟΜΙΧΑΛΑΙ, τυπογραφείο Ανέστη Κωνσταντινίδη) απαντώντας σε έναν λόγιο που επαινούσε τους Μαυρομιχαλαίους για την δολοφονία είχε πει: «Δεν μετράς καλά φιλόσοφε. Ανάθεμα στους Αγγλογάλλους, που ήταν η αιτία κι εγώ έχασα τους δικούς μου, και το Έθνος έναν άνθρωπο που δεν θα τονε ματαβρεί, και το αίμα του με παιδεύει ως τώρα».
Πάντως σε όλες τις περιπτώσεις δεν μπορεί να χρεώσει κάποιος το Εθνικό έγκλημα της δολοφονίας του Ιωάννη Καποδίστρια σε όλους τους Μαυρομιχαλαίους, που οι περισσότεροι διαχώρισαν την θέση τους από την δολοφονία και πολύ περισσότερο σε όλους τους Μανιάτες.